Наследница знаменитой фамилии охотников на нечисть и истребителей вампиров маленькая Интегра Фарбрук Хеллсинг попала в опасную ситуацию и была спасена бессмертным и грозным вампиром Алукардом. Будучи после этого подвига пойман и заточен в подвале старинного замка кровосос провел в оковах несколько лет.

Подросшая героиня закономерно обрела право и после упорных тренировок со специальном оружием и приспособлениями вступила в организацию "Хеллсинг Ultimate", чтобы продолжить борьбу с самыми разными проявлениями мрачных и злобных сил, довольно часто появляющихся на территории Великобритании. Оборотни, зомби, демоны и прочая нежить последнее время стала регулярно беспокоить обычных жителей, сея страх и панику и вынуждая населения обращаться за помощью к охотникам.

Отважной Интегре пришлось освободить из плена своего спасителя, получив от него заверение в полной лояльности и неукротимом желании самому бороться с монстрами и чудовищами. И он действительно не пропускает ни одну цель, ловко уничтожая опасные сущности. В это время заметно активизируется деятельность 13-го отдела борцов с мировым злом, созданная при администрации Ватикана и получившая название "Искариот".

Рыцарями, широко использующими боевую магию, руководит отважный паладин Александр Андерсон. Появляется информация о тайной организации "Миллениумом" также готовой присоединиться к борцам с нечистью.